Začiatok
Po spustení hry zlez výťahom dole a nastúp do auta. Postupne preskúmaj všetky lokácie a získaj celkove 9 stôp nasledovnými úlohami.
Chemické nádrže
Hádankár sa pokúša nechať pretiecť nádrže v chemických továrňach. Jediným spôsobom ako vytekaniu chemických látok zabrániť je preťažiť poistky, tie sú však umiestnené až v nádržiach spodného poschodia. Tvojou úlohou je teda vytvoriť taký systém nádrží a potrubí, ktorý umožní, aby tekutina bezpečne pretiekla dole a mohla naplniť spodné nádrže. Smer toku môžeš upravovať pákami, ktoré udávajú, z ktorej strany je potrubie otvorené. Nenechaj však žiadnu z nádrží pretiecť. Keď naplníš všetky spodné nádrže, nezabudni odpojiť prítok.
Mrazivé mrakodrapy
Mr. Freeze mrazí miestne kancelárske budovy. Tvojou úlohou je nájsť v ornamentoch na dlaždicovej stene opakujúci sa vzor, ktorý sa tiahne celou stenou od prvého poschodia až na strechu. Ak ho nájdeš stačí, keď ho vyberieš dole v ponuke a klikneš na dlaždicovú stenu.
Hádankárove bludiská
Tvojím cieľom je nájsť v bludisku plošín, rebríkov, kamenných kvádrov a nepriateľov 3 odložené stopy. K pohybu slúžia šípky, skáčeš medzerníkom a využiješ aj všetky 4 nástroje, ktorými si vybavený. Prepínať medzi nimi si môžeš hore na obrazovke pomocou myši, použiť idú stlačením klávesy Ctrl.
Lúštenie na základni
Akonáhle získaš všetkých 9 stôp, vráť sa do jaskyne. Choď k počítaču, potom ako zadáš do počítača všetky informácie naskenované zo všetkých stôp, objaví sa 9 útržkov textu, zašifrovaných do divných symbolov. Ku každému písmenu patrí jeden symbol, ako to vidíš na obrázku, ktorý ti pomôže pri lúštení všetkých textov.
Potom ako dekóduješ všetky texty, musíš utvoriť 6 hádaniek. Z toho 3 sú už kompletné a ďalšie 3 musíš pospájať. Ak si nebudeš vedieť pomôcť, tak utvor tieto hádanky:
Kde muzes studovat bez knih? V laboratori.
Ktere drahe kameny maji zlocinci radi? Granaty.
Kde najdes zapalky blizko zoo? Na konci slovniku.
Nakoniec musíš ešte pospájať písmená, ktoré sa ti zobrazujú hore pri vetách do názvu Gotham City.
Finále
Po vyriešení hádaniek choď dole výťahom a nastúp do helikoptéry. Teraz budeš musieť zastaviť nebezpečné toxické látky. Na pohyb slúžia šípky a strieľaš medzerníkom. Najprv musíš vybrať hore na obrazovke správny neutralizátor, ktorý správne doplní vzor na každej nádrži. Vždy musíš strieľať do začiatku toxického prúdu. Po splnení finálovej úlohy je Gotham City opäť zachránené a Hádankár s Mr. Freezeom skončia za mrežami.